Cell | 免疫疾病之前免疫细胞特异基因调控动态全景图

筑波大学的研究课题执法人员和RIKEN Research研究课题所的同事们从未组织起来了首个针对自身自体性病症和自身黏膜性病症的蛋白质数据集库。努力这一水资源能为自体病症的转型共享取而代之见解，并或许有助于药物的推测。生物学家们还努力，与自体关的的蛋白质组数据集图解终于或许应用于诸如COVID-19等传染病的研究课题。

筑波大学概念设计研究课题助理，针灸风湿病学家，新功能蛋白质组学专家Mineto Ota博士知道：“要了解病症，就必需深刻解读蛋白质人体内的新功能。有了这个数据集集，我们就可以将与病症关的的DNA基因序列发生变化的数据集与对病症发病前提并不重要的蛋白质和细胞核种类联系上去。”Ota是该团队发表文章在《Cell》杂志上的文章的主要作者，文章标题为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该概念设计是与Chugai Pharmaceutical的生物学家们合作关系开展的。

作者曾知道，自体抑制的病症（IMD）都有从自身自体性到自身黏膜的多种病理。他们反驳新，尽管IMD之中炎性STAT的异常活动表明巨噬细胞核新功能牵涉到了发生变化，但是，“对于IMD的关的蛋白质甚至关的细胞核种类知之甚少。”

仅有蛋白质组联系研究课题（GWAS）推测了许多与IMD关的的蛋白质组亚基。但是，在此类联系研究课题之中确认出新的许多蛋白质人体内都坐落适度蛋白质“on”或“off”表达出来的DNA非编码周边，而不是坐落蛋白质编码基因序列之中。研究课题工作小组反驳新：“GWAS从未阐述了许多与简单性状和病症关的的蛋白质组亚基，都有IMD。这些人体内之中的大多数都坐落非编码蛋白质组周边，尤为是管控元件，如增强子和启动子。”

为了阐述管控DNA的新功能，一种有所不同种类的蛋白质组深入研究，称为表达出来定量性状蛋白质亚基（eQTL），旨在将DNA基因序列的关联与蛋白质表达出来的关联联系上去。来进行eQTL数据集，研究课题执法人员可以对管控DNA基因序列的目的、管控基因序列之中的人体内如何不良影响其管控蛋白质的表达出来以及这些蛋白质表达出来关联如何导致病症得出结论新非常慎重的臆测。

其它针对自体的eQTL研究课题从未在开展之中，但先前的研究课题工作只都有保健志愿，并核对了有限存量的细胞核种类。研究课题执法人员曾知道：“对保健酪氨酸巨噬细胞核的研究课题或许必需捕获病征完全下推测的一系列eQTL不稳定性。此外，虽然对巨噬细胞核的实验性刺激可以在某种程度上虚拟病征完全，但并不总是反映出新细胞核内的环境因素环境污染。”

Ota足量道：“炎征完全下，巨噬细胞核的物理特性与保健完全下的有所不同细胞核截然有所不同。与自体状况关的的蛋白质人体内或许只在患病完全下起起到，因此对于这种种类的蛋白质研究课题，从真实病患头上获取样本并不重要。”

在他们同类型报导的研究课题之中，研究课题工作小组对79名保健志愿和337名被病症患有10种有所不同种类自体抑制病症（都有类风湿性关节炎、有系统皮肤病和有系统帕金森氏症）的病患开展了仅有蛋白质组高通量。所有志愿都是韩国血统。

了解自体抑制的病症很强挑战性，因为尽管每种病症在针灸上都是有所不同的，但仍有许多重叠之处，并且很强有所不同病症的病患或许会表现出新并不有所不同的征状。研究课题执法人员足量知道：“由于所有这些丰富性，一次学习一种自体抑制病症的能力是有限的。但是，如果我们一起研究课题10种病症，就可以非常仅有面地了解这些种类的病症。”

在完成仅有蛋白质组高通量后，研究课题执法人员从志愿的血浆样本之中制备新28种有所不同种类的自体关的细胞核，并观测了这些细胞核之中的蛋白质表达出来。“我们在图解之中看到，每种巨噬细胞核种类都有有所不同的eQTL结果，这可以告知我们细胞核种类之间蛋白质管控的关联，以及哪种细胞核种类对于转型哪种病症至关重要。”研究课题执法人员知道。

作者报告知道，“在蛋白质表达出来深入研究之中，我们在一个平台上对多个IMD开展较为，使我们必需揭示每个病症（病患）的特征，并识别与单个病症抗体关的的蛋白质，以及在一组IMD之中肥胖的通路……我们的数据集集使我们必需检测每个特定细胞核种类之中eQTL不稳定性的环境因素（病症）背景涡轮机的干扰。”

研究课题执法人员将获取的水资源命名为筑波大学巨噬细胞核蛋白质表达出来图解（ImmuNexUT），并知道它代表了使用亚洲地区血统志愿组织起来的第二大的eQTL数据集集。他们总结道：“我们确定了巨噬细胞核种类抗体的eQTL不稳定性，都有现在未报导的常见细胞核种类，它们在环境因素黏膜先决条件下的丰富性，以及这些eQTL与IMD遗传之间的非常大联系。”

“到即便如此，在这一领域，大规模的蛋白质组和新功能蛋白质组研究课题主要是来进行之中欧这些年来开展的，尽管社会性丰富性对于精确解读蛋白质组新功能至关重要。”研究课题执法人员知道，“这个韩国人脑的eQTL图解对于克服这种以之中欧为之中心的无知，建构之中欧的数据集集有利于研究课题DNA人体内的新功能，也很强重要意味。”

研究课题执法人员努力ImmuNexUT数据集库将再次增长，并终于为病患造就必需的结果。他们知道：“与先前报导的水资源远比，我们的数据集集很强新颖而有利的特点，都有仅有面的巨噬细胞核细分、这些年来之间自体状况的发生变化以及所谓的非之中欧这些年来。”